2005年，三峡库区水环境质量监测内容主要包括长江干支流水质和回水区“水华”预警和应急监测。水质评价和测试方法执行《地表水环境质量标准 GB3838－2002》，水体综合营养状态评价执行中国环境监测总站制定的“湖泊(水库)富营养化评价方法及分级技术规定”。
　　
　　5.1 库区水质监测
　　
　　2005年，在库区共布设13个水质监测断面，其中长江干流6个，一级支流7个。干流断面分别为重庆朱沱、铜罐驿、寸滩、涪陵清溪场、万州沱口和巴东官渡口，支流断面分别为嘉陵江北碚、临江门、乌江武隆、御临河口、澎溪河口、大宁河口和香溪河口。水质评价项目包括pH、溶解氧、高锰酸盐指数、五日生化需氧量、氨氮、石油类、总磷、汞、镉、砷、铜、铅、铬(六价)等13项。
　　
　　5.1.1 库区干流水质
　　
　　2005年，库区干流水质较好，6个断面水质均为Ⅲ类，各月均未出现劣Ⅴ类水质断面。
　　
　　5~9月，除官渡口断面水质为Ⅲ类外，其余5个断面水质均存在超标现象，7~9月尤为突出，总磷、铅和高锰酸盐指数为主要超标物；其余各月各断面水质均达到或优于Ⅲ类。

　
表5－1　2005年三峡库区长江干流断面水质类别

　　5.1.2 库区支流水质
　　
　　2005年，库区支流水质较差，无Ⅰ类和Ⅱ类水质断面，Ⅲ类和Ⅳ类水质断面分别为3个和4个，比例为42.9%和57.1%。其中，北碚、武隆和临江门断面水质均为Ⅲ类，御临河口、澎溪河口、大宁河口、香溪河口断面因总磷超标水质均为Ⅳ类。

　　5.2 库区“水华”预警和应急监测
　　
　　5.2.1 “水华”预警监测
　　
　　2005年，对重庆库区13条长江一级支流回水区进行了“水华”预警监测，在每条支流回水区的中段和尾段各布设1个监测断面，共26个。采用叶绿素a、总磷、总氮、透明度、高锰酸盐指数等5项指标评价水体综合营养状态。
　　
　　监测结果表明：2005年3~5月，9~10月，重庆库区回水区水体处于富营养状态的断面比例分别为12.5%、23.1%、19.2%、19.2%和7.7%。其中，万州区苎溪河南门口断面和巫山县神女溪倒车坝断面曾出现水体处于重度富营养状态的情况。

　　表5－3　2005年三峡库区回水区断面水体综合营养状态

　　
　　5.2.2 “水华”应急监测
　　
　　2005年，三峡库区回水区多次出现“水华”现象，库区各级环境监测站及有关部门及时开展了现场应急监测。重庆市环境监测中心和长江流域水环境监测中心的监测结果显示：2005年，库区回水区“水华”现象出现时间集中在3~7月。
　　
　　3月上旬，巫山县抱龙河、大溪河出现“水华”，河段长度分别约3.0公里和5.0公里，水体均处于中度富营养状态。3月中旬，巫山县抱龙河、大溪河、大宁河，秭归县童庄河、叱溪河、坝前木鱼岛均出现“水华”，其中抱龙河、大宁河、大溪河“水华”河段长度分别约5.0公里、7.0公里和5.0公里，水体呈中度富营养、轻度富营养、中~重度富营养状态；秭归县童庄河、叱溪河、坝前木鱼岛水体呈褐色。3月下旬，巫山县抱龙河、神女溪，云阳县磨刀溪、汤溪河、澎溪河、长滩河、长江捌角处出现“水华”，河段长度分别约4.0公里、2.5公里、3.0公里、2.5公里、3.0公里、1.5公里和1.0公里，水体呈中~重度富营养状态。
　　
　　4月，梅溪河出现甲藻“水华”，水体呈酱油色，优势种为拟多甲藻(Peridiniopsis sp.)，藻类密度高达3.0×107个/升；4月下旬和5月上旬，万州区瀼渡河出现“水华”，水体呈中度富营养状态。5月上旬，奉节县梅溪河、朱衣河、草堂河出现“水华”，水体呈轻度~中度富营养状态。5月下旬，梅溪河水体再次呈中度富营养状态。
　　
　　7月，香溪河出现蓝藻“水华”，水体呈蓝绿色并伴有浓烈的腥臭味，优势种为颤藻(Oscillatoria sp.)，藻类细胞密度高达1.1×108个/升。