5月5日，环保部副部长李干杰率领核与辐射安全检查组对清华大学核研院和中国原子能科学研究院的核与辐射安全状况进行了检查。清华大学核研院和中国原子能科学研究院分别对本单位的核设施和核技术利用装置的运行状况进行了汇报，检查组对部分核设施和核技术利用装置现场进行检查后，与有关人员进行了充分交流。李干杰副部长对清华大学核研院和中国原子能科学研究院提出要求：一是要提高风险意识，安全责任落实到人，确保核与辐射设施的运行安全；二是要确实做好核与辐射设施的实物保护工作，加快实物保护系统的改造工作，加强技防和人防措施，并组织落实；三是要充分做好应急准备工作，强化应急值班，并充分进行应急演练。
　　
　　5月6日，环保部副部长张力军在成都听取了四川省人民政府、成都市人民政府环保工作汇报，并现场查看了成都市小流域环保治理工程。在听取四川省人民政府副省长陈文华、成都市委常委、副市长曾万明工作汇报后，张力军副部长在西南环保督查中心主任马宁陪同下视察了成都市凤凰河二沟快渗湿地污水处理工程。四川省环保局局长田维钊、副局长谷声文，成都市环保局局长王文斌，以及四川省发改委、建设厅、水利厅、农业厅、畜牧食品局等有关单位负责人参加了汇报会。　　
　　5月6日下午，张力军副部长视察了西南督查中心。张力军副部长充分肯定了西南督查中心组建以来所取得的成绩，认为西南督查中心经一年半的组建，目前已基本形成工作能力，成绩显著。当前区域环保督查中心的主要工作仍是总量核查，望大家抓住重点，再接再厉，不辱使命。张力军副部长还详细察看了中心装备建设，特别是8辆执法监察车的运行情况。张力军表示，环境保护部还要进一步加大区域督查中心执法装备力度，一定要把督查中心打造成环保执法的“钢刀”。陪同张力军副部长视察的有四川省环保局局长田维钊、副局长谷声文，成都市委常委、副市长曾万明，成都市环保局局长王文斌等。
　　
　　5月8日至9日，全国土壤污染状况调查报告编写技术培训班在北戴河中心举办，来自全国31个省、自治区、直辖市环保局和监测中心的105名工程技术人员参加了培训。
　　
　　5月9日，张力军副部长在西南督查中心主任马宁的陪同下，视察了重庆三峡库区水污染防治工作。张力军一行从万州区乘坐重庆环保001号监测船沿江而下，查看了位于三峡库区的万州区、云阳县、奉节县、巫山县等地污染防控和库区蓄水后的水质情况，在船上听取了重庆市环保局对三峡库区污染防控、水华监测、应急预案落实等情况汇报，以及对水华高发期三峡库区及其上游污染防控的对策建议。张力军要求，三峡库区及其上游省、市要进一步加强库区流域污染防控研究，加大水专项治理资金投入，加密水质监测频次，尽快提高应急监测能力，配齐库区水质和生态监测设备，装备水华应急清理船，确保三峡库区及其上游水环境安全。张力军在通报了西南环保督查中心近期对重庆市开展总量减排日常督查、三峡库区部分地区水污染防治暗查和重点案件后督察情况后表示，环保部将对其中存在严重环境违法行为的企业进行挂牌督办，并要求重庆市积极行动起来，抓好国家挂牌督办企业的整改落实，同时依法处理其他存在环境污染问题的企业。
　　
　　由中国环境文化促进会、美国自然资源保护委员会和绿家园志愿者主办、上海市环保宣教中心协办的第二届“信息公开与环境保护研讨会”于5月9日—10日在上海华晶饭店举办，促进会秘书长王磐璞出席并做开幕致辞。环保部政策法规司副司长别涛、上海市环保局副局长孙建、上海市环保局法规处处长黄震、上海市环保宣教中心主任胡恺建、美国自然资源保护委员会—NRDC中国环境法项目主任王立德、绿家园志愿者召集人汪永晨、中国政法大学环境资源法研究所，污染受害者法律援助中心教授许可祝、美国马里兰大学法学院环境法项目教授Robert Percival、上海交通大学环境资源法研究所副教授赵绘宇等嘉宾及来自全国各新闻媒体和环保NGO的代表共50余人参加了此次座谈会。
　　
　　环保部总量办于2008年5月7日至12日组织环境规划院、中国环境监测总站、中国造纸协会、中国电力企业联合会、中国石化协会、中国轻工业清洁生产中心以及清华大学、北京理工大学等单位的专家，在北京召开了天津、上海等二十七省（市、区）和新疆生产建设兵团2008年度污染减排计划讨论会。专家们认真听取了各省（区、市）2008年减排计划的介绍，进行了研究和讨论，重点对减排年度目标制定的合理性和可达性、减排项目措施的可操作性、新增量测算合理性等提出意见。各省（区、市）环保部门与会人员表示将按照专家的意见与建议，抓紧对年度减排计划进行修改完善，并尽快报政府批准实施。此前，总量办已组织完成了31个省（区、市）和新疆生产建设兵团年度减排计划的审核工作。通过审核讨论，进一步明确了各地2008年总量减排的具体目标和任务，规范了各地减排工程措施实施方案，为全国2008年总量减排目标的顺利实现奠定了基础。
　　
　　5月12日，四川省汶川县发生重大地震灾害后，陕西部分地区及西安市均有明显的强烈震感，西北督查中心及时向环境保护部通报了震情。根据环境监察局陆新元局长的指示，5月12日晚，西北督查中心汪冬青副主任分别与陕、甘、宁、青四省区环保局主要负责同志通电话，传达环保部的重要指示，要求各省区向环境保护部及时报告震后情况，组织开展环境安全隐患排查，并安排环保执法人员对尾矿库、污水处理厂、垃圾填埋场、有毒有害化工企业等环境敏感部位进行检查，做好环境应急的相关准备工作。5月13日早晨，西北督查中心派出三个工作组，分别由张军、王一鸥副主任带队，分赴陕西省受灾影响较大的汉中、安康、宝鸡市，代表环境保护部及环境监察局慰问一线环境执法人员和环保工作者，了解上述区域环境敏感问题的相关状况，并对各地环境应急准备工作进行督查，配合地方环保部门严密监控，加强环境隐患排查，确保环境安全。截至目前，三个检查组电话反馈的信息表明，受5.12地震波及的地区，环保监测仪器和分析玻璃器皿有部分毁坏，一些企业治理设施也有损坏现象，如有些尾矿库坝出现裂缝，城市污水厂的水池有开裂现象，但所到之处尚未发现重大环境安全隐患问题。有关详情待后续报。
　　
　　5月12日下午14点27分左右，四川省阿坝州汶川地区发生7.8级强烈地震，成都地区震感明显，灾区人民群众生命财产损失巨大。在几次较大的余震过后，下午17时，西南环保督查中心（以下简称中心）主任马宁在中心办公楼下召开临时主任扩大会，决定立即启动环境应急预案，成立地震应急指挥部，马宁任总指挥，抽调全部在家的22名同志和6台车辆，分别成立了现场、四川及成都、西南地区和信息调度等9个组。17时30分，8个现场组连夜奔赴川、渝、黔、云四省市开展现场应急工作，深入灾区第一线和企事业单位搜集灾区地震震级、伤亡情况、各地污水处理厂、工业企业等重点污染源污染治理设施运行和受损情况，以及重点饮用水源水质状况。截止13日14时20分，各组收集信息近百条，先后向环保部上报了中心应对地震灾害和抗震救灾的初报、急报和续报共计14期。 　　
　　从12日17时30分开始，西南督查中心由班子成员和处、科级干部带队的9个现场组连夜奔赴川、渝、黔、云四省市开展抗震救灾现场巡查工作。13日11时15分，环境保护部副部长李干杰一行紧急赴川抵达成都双流国际机场，在马宁同志的陪同下组织开展抗震救灾环境应急工作。截止14日14时，中心抗震救灾工作组先后出动70人次，行程约3500公里，到达川、渝、黔、云四省市的20多个市、区、县，检查污水处理厂、垃圾处理场、工业企业和饮用水源地等共计47家（其中，工业企业22家，污水处理厂18家），收集信息约150条，先后向环保部上报了中心应对地震灾害和抗震救灾的初报、急报和续报共计35期。
　　
　　5月13日15时，中国环境监测总站魏山峰站长主持召开应急工作专题会，研究部署应急监测工作。魏站长通报了环境保护部办公厅第20至25期值班信息专报和四川省环境监测中心站关于德阳、南充、广元、绵阳市监测站丧失监测能力的快报，传达环境保护部下发的防止次生灾害、次生环境事件的工作方案。魏站长要求办公室做到机要室24小时值班，人事纪检室排好站领导、中层干部值班表。抽专人做好信息报送工作，重要信息随时报。灾区监测站损失情况由综合室统计后及时上报。分析室、水室、大气室、污染源室要做好应急准备，李国刚副站长带领有关人员赶赴一线，卢秀玲副书记负责后勤保障。要立即组织有关职能室的同志传阅相关专报、快报。各室的工作要相应调整，集中精力做好应急工作。
　　
　　为应对四川省强震灾害，根据环保部的安排，中国环境监测总站紧急启动环境应急监测机制。1、5月13日，向各省、自治区、直辖市环境监测中心（站）下发了《关于组建抗震救灾应急监测支援队伍的通知》，组织应急监测支援队伍。2、5月13日，向环保部规划司报送了《总站现场应急设备、分析测试能力及可支援仪器设备一览表》，组织应急监测设备。3、5月13日，向环保部科技司报送了《关于报送抗震救灾期间应急监测工作方案和指导意见的函》，组织应急监测技术支持。4、5月13日，向四川省环境监测中心站发出慰问电，并及时拨付10万元应急监测工作经费。